航空1907号班机的机长在完成这一指令后并没有停止下降，反而让客机继续下降，已经低于14000英尺。调查报告指出，哈萨克斯坦航空1907号班机机组人员的英语水平极低，而且完全依靠他们的无线电通讯官与地面控制中心管制员联系，这两个原因造成1907航班未能按照管制员指示去做，最终犯下了严重错误。

    这一结论立即遭到了哈萨克斯坦官员的反驳。哈萨克斯坦方面称，在飞机下降的时候，1907号班机不幸进入了积云之中，并且还遇上湍流，糟糕的天气才是导致事故的最主要原因。

    航空交通管制员工会的代表对哈萨克斯坦方面的说法进行了反驳。他们引述气象报告，称当时并没有湍流，但同意两航机在云团中相撞的说法。这一说法从目击证人提莫菲·毕斯的证供中获得了证实。最终，调查委员会认定事故的主要原因就是哈萨克斯坦航空1907号班机的机长没有严格遵从管制员保持指定高度的指示。然而，报告对1907号班机机长为什么没有遵从指示的原因则未作出定论，仅仅说有两个可能性：要么是因为航机在云团中遇上湍流，要么是因为机长与管制员沟通存在问题。

    还有一点需要指出，当地机场的设备也是非常落后的。英迪拉·甘地国际机场当时并没有二次监察雷达来测量航机的实际飞行高度，使用第一次监察雷达估计飞机的飞行方向已经过时，这种不准确的航空资料，在某种程度上会影响地面管制员的判断。另外，当时的一般的民航管制区都是把进场航线和离场的航线分开的，但是，印度空军占用了德里附近太多的空域，德里的航机只能使用同一条“空中通道”来进场和离场。这极大地增加了航机发生空中相撞的概率。