栋梁之才，还铲奸除恶，积极改善社会政治气氛。明仁宗在杨士奇的影响下也称得上是一个开明有为的好皇帝。他感激杨士奇对自己的辅助和忠心，特意赐给杨士奇一枚“杨贞一印”。

    洪熙元年（1425年），明仁宗去世，明宣宗朱瞻基即位。杨士奇同另外二杨仍是朱瞻基的内阁辅臣。朱瞻基即位之初，外有交趾国公开抵制明朝统治，内有汉王朱高煦蠢蠢欲动。宣宗皇帝没日没夜地招杨士奇、杨荣二人晋见，商讨国家大计。不久，汉王反叛。很快，宣宗御驾亲征，调集主力军队镇压叛军。对外，明朝在军事压制的前提下，通过外交途径、以“给予更大自主权”来换取交趾国的臣服和边疆的稳定。不到两个月，国家政局趋于稳定，社会气氛大大缓和。

    宣德十年（公元1435年），明宣宗朱瞻基去世，年仅9岁的明英宗朱祁镇继位。于是，朝中形成两大派别，一派是张太皇太后支持的“三杨”，另一派便是控制了司礼监的大宦官王振，他是小皇帝的启蒙老师，深得小皇帝依赖。

    正统五年（1440年）前后，在兵部尚书徐晞的支持下，王振抓住“东杨”杨荣曾收受贿赂的把柄，设计陷害杨荣，杨荣获罪下狱。此时，杨士奇不顾个人生死，为杨荣求情。英宗念其曾经有功于朝廷，免了杨荣的牢狱之灾。不久，杨荣病死。“三杨”之中的“南杨”杨溥严守中立，没有面对艰难政治环境的勇气。至此，仅剩下74岁的杨士奇独撑着明朝的政局。

    对自己的儿子，杨士奇却并没有留情面。他的儿子杨稷飞扬跋扈，没有丝毫本事。后来杨稷杀了人，遭到了言官们的劾举。碍于杨士奇的面子，皇上并没有立即下旨治罪，但是接着又有人告他儿子“横虐数十事”，皇帝这才下令查治。年老的杨士奇为了避嫌，告老还乡。朝廷安慰并且挽留他，杨士奇感激涕零，但婉言谢绝了。但毕竟事关儿子的死活，一代名臣最终忧郁而死。杨士奇死后，其子杨稷被绳之以法。