1916年  丙辰 51岁

    3月，袁世凯宣布取消帝制。5月，从日本回到上海，发表《讨袁宣言》，号召推翻袁世凯。

    1917年  丁巳 52岁

    2月 21日，完成《民权初步》著述。6月 10日，和章太炎联名致黎元洪等电，必须铲除北洋军阀复辟势力，7月张勋复辟，孙文号召护法。时任广东省长的朱庆澜邀孙赴

    粤。孙文、唐绍仪、汪兆铭、伍廷芳等人南下广州。8月，召开国会非常会议，决定成立中华民**政府。9月，军政府在广州正式成立，孙文当选大元帅，唐继尧、陆荣廷为元帅，章太炎被任命为护法军政府秘书长。11月，广州护法政府逐渐由旧桂、滇系军人控制。

    1918年  戊午 53岁

    5月，桂、滇各系控制国会改组护法政府，改为七总裁合议制，孙文辞去大元帅职务，权力被架空。6月，东渡日本。8月，由日本返回上海。12月，写成哲学著作《孙文学说》，论述知难行易。

    1919年  己未 54岁

    2月 20日，北洋政府与广州军政府开始议和。6月，《孙文学说》公开出版。5月 1日，命朱执信、廖仲恺等人创办的《建设》月刊出版，亲自撰写发刊词，以“激发新文化，灌溉新思想”。

    8月，因军政府投靠北洋军阀，私下议和，践踏护法旗帜，正式辞去军政府总裁职务。10月，改中华革命党为中国国民党。

    1920年  庚申 55岁

    8月，陈炯明成功击退盘踞广州一带的桂、滇系，请孙文重回广州，9月，派徐季龙等去争取冯玉祥站在革命方面，以分化军阀势力。组织湘军、赣军、滇军进取广东，与粤军共同讨伐桂系军阀。11月，与伍廷芳、唐绍仪等从上海回到广州。12月，恢复军政府，自任内政部长，唐绍仪为财政部长，唐继尧为交通部长，陈炯明为陆军部长。