在当时所谓的忠义主从关系备受重视的武士世界中，他们这些不以忠义为意而靠特殊技能为卖点，并且可以被雇用的忍者集团，就成了最便利的人才资源，因此各大名都很愿意收罗这样一股特殊的势力。

    同时，“忍者”这个名词也有了明确的含义。首先，作为一个忍者要遵守四条基本戒条：第一，不准滥用忍术；第二，舍弃一切自尊；第三，即使死也要守口如瓶；第四，绝对不泄露身份。

    其次，“忍者”们都具备高强的专门技艺，也就是忍术，同时还具有过人的忍耐力和生存能力。

    他们为雇用他们的主君进行秘密活动的策划，或担负护卫、破坏、暗杀、刺探情报等工作，并且大多需要一辈子隐姓埋名过着不见天日的生活，不可以留下片言只语，以免被敌人发现后危害到雇用者或忍者集团。

    与此同时，伊贺出现了像百地丹波守、藤林丹波守、服部半藏这样一些优秀的技术指导者和杰出的忍者领袖人物，他们或培养人才，或率领一族，分别组织了各种忍者集团。这些人，通常被称为“上忍”，以区别于一般的忍者。而一般进行具体行动的忍者则被称为“下忍”。在后世，“上忍”的概念又出现了延伸，一些具有忍者特质的领导者，也会被称为“上忍”，譬如具备了超强隐忍能力的德川幕府的开创者德川家康。