大将军陶侃为征西大将军、都督荆湘雍梁四州诸军事、荆州刺史，王舒为安南将军、都督广州诸军事、广州刺史。偏偏天公不作美，全国大旱，自正月开始就不下雨，为此，司马绍再次下诏曰：

    三恪二王，世代之所重；兴灭继绝，政道之所先。又宗室哲王有功勋于大晋受命之际者，佐命功臣，硕德名贤，三祖所与共维大业，咸开国胙土、誓同山河者，而并废绝，禋祀不传，甚用怀伤。主者其祥议诸应立后者以闻。

    又诏曰：

    郊祀天地，帝王之重事。自中兴以来，惟南郊，未曾北郊，四时五郊之礼都不复设，五岳、四渎、名山、大川载在祀典应望秩者，悉废而未举。主者其依旧详处。（《晋书?帝纪第六》）

    这两段话的意思说白了就是要通过“兴灭国，继绝世，举逸民”来加强“精神文明”建设，通过对“神明”的祭祀来证明自己得位的合法性！

    平定了王敦叛乱集团，晋明帝的威望也达到了空前的高度。晋明帝是一位宽宏大度的君主，他先赦免了叛军士兵，随后又赦免了王敦的旧部将领，并重新任命王导、陶侃等人各司其职，任贤使能，使东晋的局势开始向好的方向发展。

    这个时候明帝又开始处理国内的另外一些矛盾。比如说，从长江以北避难而来的北方士族与南方本地士族之间有矛盾，为了实现政治平衡，他在临终前的一个月还下诏书要各地的地方官员巡访三国孙吴时代将相名贤之后。诏曰：

    昔周武克殷，封比干之墓；汉高过赵，录乐毅之后，追显既往，以劝将来也。吴时将相名贤之胄，有能纂修家训，又忠孝仁义，静己守真，不闻于时者，州郡中正亟以名闻，勿有所遗。（《晋书?帝纪第六》）