次年晋升为上校。1933年 5月起，他先后任驱逐舰护航舰队参谋长、海军军事学院战术系主任。在所有这些任职期间，他均获得优等的成绩。1938年春季，斯普鲁恩斯奉命指挥战舰“密苏里”号，两年后，他升任海军少将。

    升任将官之后，斯普鲁恩斯第一项新职就是担任刚成立的海军第11军区司令。1940年2月26日，斯普鲁恩斯到司令部设在波多黎各的圣胡安任职。此时，第二次世界大战已经在欧洲战场爆发。美国为了巩固在加勒比海地区中的地位，正在建立一系列的基地用来保护巴拿马运河和来往于南、北美洲之间的航运，斯普鲁恩斯就成为指挥这一工程的指挥官。1940年6月，法国沦陷，斯普鲁恩斯的责任就更大了。

    像大多数海军军官一样，斯普鲁恩斯总是希望回到海上。不久他就如愿以偿，1941年9月，他奉命到珍珠港接管第5巡洋舰支队。17日，到任后的斯普鲁恩斯把他的将旗升在重巡洋舰“北安普敦”号上。此时，已升为中将的哈尔西是第8特遣舰队的指挥官，他的旗舰叫“企业”号，而斯普鲁恩斯的支队正好属于这支部队，这就为斯普鲁恩斯再度和哈尔西共事创造了机会。11月28日，哈尔西奉命从珍珠港出发，运送战斗机前往威克岛。1941年12月7日上午，日本人发动了臭名昭著的偷袭珍珠港事迹由于天气恶劣，第8特遣部队仍留在海上，所以躲过了这一灾难。

    珍珠港事棘发后，面对这种烂摊子，美国派尼米兹到珍珠港管理军事事务。12月底，尼米兹接管太平洋舰队。到任后，尼米兹马上命令哈尔西发动对吉尔伯特和马绍尔等群岛的突袭，接着又发动了包括对东京的空袭在内的更多的攻击。每次出击，都是由哈尔西指挥特遣舰队，而斯普鲁恩斯担负护航的任务。但斯普鲁恩斯认为这种攻击实在是浪费时间，他主张应较好地利用航空母舰，而不应只为了制造头条新闻而让如此高价的战舰作不必要的冒险。

    1942年4月18日，美军空袭东京后，日本认为威胁来自中途岛，遂决心实施中途岛—阿留申群岛战役。中途岛位于夏威夷岛链的西端上，离檀香山西北面有1200英里，是北美和亚洲之间的海上和空中交通要冲。山本五十六发动这一战役的真正目的是想引诱美国舰队投入会战，然后予以歼灭。

    山本五十六发动这一战役的绝密文蓟尼米兹破解。这样，胸有成竹的尼米兹马上在中途岛采取行动。1942年5月28日，斯普鲁恩斯率领第16特遣舰队离开珍珠港，他的任务是“守住中途岛并用强烈的消耗战术使敌军受到最大的损失”。不久，尼米兹又通过另一封密函向他指示：“你应尊重冒一定危险的原则。”其含意就是告诉他保护航空母舰比守住中途岛更重要。因为山本感兴趣的是毁灭美国舰队而并非攻占中途岛。斯普鲁恩斯出色地完成了这一任务，为美国在中途岛大海战中取得胜利奠定了坚实的基础。