魏大将侯景派人前来接洽投降。这个人臭名昭著，名声也不好，群臣纷纷反对，武帝有点不悦，又是朱异揣知皇上心意，力劝萧衍纳降侯景：“您的伟大，谁不仰慕?只是他们没有机会表达心意。现在侯景带着土地归降，实在是天意，如果拒不接纳，恐怕会断绝后来之望，还是别怀疑了。”当时，武帝年过半百，已听不得那些反对言论了，他十分满意朱异的上奏，不仅决定收留侯景，还用高规格待遇来迎纳侯景，祸根也就此埋下了。

    虽然朱异为侯景做过那么多工作，但侯景显然并不领情。公元546年，距离投降不过一年，侯景在寿阳造反。当侯景大军眼看即将越过采石（石头城，东吴大帝孙权建筑的江防工事）直逼首都时，武将首领羊侃建议梁武帝发两千精兵占据有利位置，侯景自然瓦解。关键时刻，又是朱异出来阻挡：“侯景必然没有渡江之意。”武帝当然听朱异的话。即便是英武如羊侃，也长叹道：“这下子彻底失败了!”

    当侯景渡过长江，整个朝廷还在歌舞升平，突逢变故，简直乱作一团，只能进入戒严状态。没过多久，皇帝的禁宫台城就沦为侯景团团包围下的孤城。

    这种危急时刻，朱异倒走上激进路线，或许是为了洗刷耻辱，证明自己也是忠君爱国之人，非要顶风出兵。羊侃反对：“现在如果派出去的人少，不能破敌，只能白白挫锐气；如果人多，一旦失利，城门道路受限，兵退之时必然导致大量伤亡。”但朱异就是不听，带领了一千多名将士出战。可悲的是，还没等到与侯景正面交锋，梁军扭头就跑，争着过桥，仅落水就淹死了七八百人。

    不久，朱异就在羞愧交加中发病而死。几个月后当侯景的叛军攻进台城（宫城）后，梁武帝也饿死了。有意思的是武帝至死仍没有意识到他和朱异的错误，还破格追封朱异为尚书右仆射。